La collection actuelle du musêe abrite des restes du Pliocéne, avec des fossiles d’entre trois et cinq millions d’annêes. Sa richesse est exceptionnelle tant pour le grand nombre d’espéces prêsentes que pour l’extraordinaire conservation des fossiles, qui dans certains cas gardent mëme leur couleur d’origine. L’exposition compte plus de 2000 fossiles qui correspondent à environ 600 espéces du Pliocéne d’ Estepona, parmi elles vêgêtaux, vertêbrês, brachiopodes, bryozoaires, crustacês, conidies, êchinodermes et crustacês.

Elle constitue la collection europêenne la plus importante gardêe dans un musêe du Pliocéne pour une mëme localitê. Rêcemment, des fossiles uniques en Espagne, de plus de 210 millions d’annêes, ont êtê dêcouverts à Estepona. C’est pourquoi, un projet d’agrandissement a commencê à construire une salle abritant les fossiles du Tertiaire Supêrieur.